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2007年01月10日

産総研など、イネの遺伝子数を約3万2000個と推定

　独立行政法人農業生物資源研究所は、独立行政法人産業技術総合研究所および大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所との3機関を中心とした国際共同プロジェクトRice Annotation Project（通称RAP）で、単子葉植物であるイネのゲノム全塩基配列上に存在する2万9550の遺伝子の位置を決定し、これをもとにイネの遺伝子数は約3万2000個と推定した。この数は、かつて約5万個とも予想された数よりも小さく、ゲノムサイズがイネの約3分の1であるシロイヌナズナ（双子葉植物）の2万6000～2万7000個に比べても極端に大きなものでないことを示す。

　また、イネゲノム上の遺伝子のうち2万8540がタンパク質をつくる遺伝子である可能性を明らかにするとともに、それらのタンパク質の機能をコンピュータによる情報解析と専門家のデータ精査で推定した結果、1万9969（約70％）の遺伝子の機能を説明することができたという。これらの情報は、データベースとして公開する。

　イネのゲノム塩基配列については、2004年12月に全塩基配列の完全解読が終了したが、ゲノム塩基配列自体は4種類の塩基ATGCの羅列に過ぎないという。今後の研究を進めるためには、ゲノム塩基配列上のどこにどのような遺伝子があるかという生物学的情報を明らかにする必要があったと指摘。今回の成果は、今後のイネ研究の促進に大きく貢献するものと期待されるとしている。

●公開されているイネゲノム アノテーションの一部

独立行政法人 農業生物資源研究所＝http://www.nias.affrc.go.jp/
独立行政法人 産業技術総合研究所＝http://www.aist.go.jp/
国立遺伝学研究所＝http://www.nig.ac.jp/

投稿日時: 2007年01月10日 12:21 | パーマリンク | トラックバック (0) 　｜   ▲このページの上へ
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